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一些常見的抗生素對成人使用是安全的，但兒童即使按規定劑量使用也可能出現意料不到的毒副作用，有時甚至發生嚴重的不良後果。這是由於兒童身體各組織器官尚未發育成熟，各器官的功能也不完善，抵抗能力較低，對藥物易敏感、耐受力低的緣故。臨牀醫生告誡：兒童（特別是10歲以下者）對以下幾種常見的抗生素藥物應當慎用或不宜使用。
氟哌酸（諾氟沙星）。對尿路、胃腸道、膽道及呼吸道感染等均有較好療效。該藥成人使用是較安全的，但對小兒有不少嚴重的副作用，屬小兒禁用藥物。小兒服用常可引起：胃腸道反應，如噁心、嘔吐、胃部不適、食慾不振、腹痛、腹瀉、便祕等；神經系統症狀，如眩暈、嗜睡、失眠、耳鳴、頭痛等，大多在服藥2小時後出現；過敏反應，如出現蕁麻疹、藥疹、瘙癢等證；此外個別兒童還會出現肝功能異常、溶血性貧血等。
氟啶酸（依諾沙星）。常用於泌尿道、消化道、呼吸道及耳鼻喉等感染，也屬小兒不宜使用藥物。因爲該藥除可引起噁心、腹脹、食慾不振、頭痛等外，還可致使小兒血清谷丙轉氨酶、尿素氮升高，白細胞輕度下降及皮膚過敏等不良反應。
泰利必妥（氧氟沙星或稱氟嗪酸）。臨牀上廣泛用於呼吸道、泌尿道、皮膚及軟組織、細菌性痢疾、腸炎等多種感染。但小兒使用除可能較易出現噁心、嘔吐、失眠、頭暈、頭痛等症狀外，還可導致血象改變，有報道認爲，該藥可引起BUN、肌酸酐、SGOT、ALP、總膽紅素等升高，還可影響兒童骨骼的生長髮育。
四環素。目前在城市使用較少，但在一些邊遠地區和農村仍在使用。此藥對小兒有嚴重的副作用，如可能導致小兒噁心、嘔吐、皮疹、哮喘、黃疸，甚至嘔血和便血等，對肝臟損害較嚴重，有時可致人昏迷。此外，四環素可沉積於牙齒和骨中，造成牙齒灰黃，影響小兒骨骼正常發育。
鏈黴素類（卡拉黴素、慶大黴素）。鏈黴素類藥毒副作用很大，屬小兒禁用藥物。最容易造成小兒聽覺受損甚至耳聾，對腎臟毒性大（尤其是卡拉黴素），還會導致血象變化、肝酶增高、面部及四肢麻木及視力模糊等。
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