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2007年是教育部“對口支援西部地區高校計劃”實施的第七年牞武漢大學、西安交通大學等國內名校通過師資、學科建設、科研等領域與新疆大學進行交流與合作，力助新疆大學教育再上新臺階。
2001年，教育部啓動“對口支援西部地區高校計劃”後至2005年，先後指定西安交通大學、武漢大學全面對口支援新大。
法律診所式教學是武漢大學與美國哥倫比亞大學合作的國際教學改革項目，是法碩教育的重要內容，是全國211工程院校法學教育改革的標誌性成果。2006年，根據武漢大學對口支援新疆大學計劃，該校法學博士柳正權到新疆大學法學院掛職副院長。他籌劃將法律診所式教學引入新疆大學。
經過一個學期的準備，新疆大學法律診所課作爲法學院選修課正式開課。新疆大學法學院大二學生李晶說：“法學專業的課程概念性很強，非常抽象。法律診所課則不同，既能通過模擬小組討論、師生間問答等方式掌握法律要點，又能通過模擬法庭演練、法律諮詢活動、免費爲當事人提供非訴或訴訟代理業務等實踐活動，熟悉法律工作事務。”
國家863計劃自動化領域首席科學家吳澄院士、中國工程院院士汪應洛、北京大學副校長、著名經濟學家海聞教授等一批著名學者，自教育部開展對口支援計劃以來，他們相繼來到新疆大學進行短期學術交流。
2005年，教育部又實施了“援疆學科建設計劃”，該計劃確定西安交通大學、武漢大學、北京大學、清華大學、北京交通大學、北京外國語大學等11所高校在21個一級學科上對口支援新疆大學。
2006年，西安交通大學派出副校級領導、工科專家王小力到新疆大學掛職任副校長，在工科建設工作中，他深入基層調查研究，爲新疆大學工科建設提出了新的發展思路，並擔任“211工程”建設工科學科羣負責人。不僅如此，針對新疆大學對專家型領導的需求，西安交通大學、武漢大學先後共派出15名專家到新疆大學掛職。這些專家在新疆大學管理工作、學科建設、科學研究、人才培養、教學改革等方面發揮了積極的作用。
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