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隨着我國社會經濟的發展，醫學教育結構不合理愈顯突出，需要加以調整。醫學教育內部存在的問題主要表現在以下方面：醫學院校的招生和培養還沒有形成有效的適應市場經濟規律的運行模式，在管理上缺乏衛生、教育和計劃部門之間的有效協調。醫學院校的招生規模、專業設置等不能較好地適應衛生事業改革與發展的需要；醫學教育的結構不夠合理，醫學各專業領域的人才培養沒有協調發展。
衛生部、教育部將調整醫學教育層次結構，壓縮中等教育，調整專科教育，積極發展本科教育，加速發展研究生教育。到2005年，包括高等職業技術教育的本專科教育和研究生教育年招生總量佔總體的比例達到60％以上，到2015年增長到70％以上。同時要調整醫學教育資源和衛生人力資源在地理分佈上的不平衡，按照區域化和醫學教育資源配置合理化的原則進行學校佈局調整，調整的重點對象是各級各類中等衛生學校。另外，開展社區衛生人才培養，加強全科醫學教育和衛生管理人才的培養，加大全科醫師的比例，積極發展醫學相關類專業。
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